Khấu trừ và nộp thuế thay trên nền tảng TMĐT: Quy định mới từ 01/7/2025

Thương mại điện tử (TMĐT) tại Việt Nam đang tăng trưởng bùng nổ. Theo Cục Thương mại điện tử và Kinh tế số (Bộ Công Thương), năm 2024, quy mô thị trường TMĐT đạt hơn 25 tỷ USD, tăng 20% so với 2023, với hơn 65 triệu người tham gia mua sắm trực tuyến. Dự báo đến năm 2025, con số này sẽ vượt 30 tỷ USD. Tuy nhiên, sự phát triển này cũng đặt ra thách thức lớn về quản lý thuế. Hàng triệu hộ kinh doanh cá thể (HKD), cá nhân bán hàng qua các sàn TMĐT như Shopee, Lazada, Tiki, Sendo, TikTok Shop… thường không kê khai thuế đầy đủ do thiếu hóa đơn, sổ sách, hoặc nhận thức pháp luật. Trước thực trạng này, Luật Quản lý thuế 2019 (sửa đổi bởi Luật 56/2024/QH15), Nghị định 117/2025/NĐ-CP và Thông tư 40/2021/TT-BTC (sửa đổi) đã chính thức quy định cơ chế khấu trừ và nộp thuế thay trên các nền tảng TMĐT, bắt đầu áp dụng từ 01/7/2025. Đây là bước ngoặt nhằm tăng tính minh bạch, giảm thất thu ngân sách và hỗ trợ người bán tuân thủ pháp luật dễ dàng hơn.

1. Đối tượng áp dụng

Cơ chế này áp dụng cho ba nhóm chính:

2. Các loại thuế được khấu trừ

Nền tảng TMĐT sẽ khấu trừ và nộp thay hai loại thuế chính:

Ví dụ: Một shop bán quần áo (phân phối hàng hóa) trên Shopee có doanh thu thanh toán qua sàn là 500 triệu đồng → Thuế GTGT khấu trừ: 500 triệu × 1% = 5 triệu Thuế TNCN: 500 triệu × 0,5% = 2,5 triệu Tổng khấu trừ: 7,5 triệu đồng.

>> Có thể bạn quan tâm: Hóa đơn điện tử; Báo giá hóa đơn điện tử.

3. Quy trình khấu trừ và nộp thuế thay

Bước 1: Xác định người bán

• Nền tảng yêu cầu người bán cung cấp thông tin thuế khi đăng ký:
  • Số định danh cá nhân (CCCD/CMND) – thay thế mã số thuế từ 01/7/2025.
  • Ngành nghề kinh doanh chính.
  • Có đăng ký hộ kinh doanh hay không.
• Nếu không cung cấp → nền tảng tạm khóa thanh toán cho đến khi hoàn tất.

Bước 2: Tính toán doanh thu

• Doanh thu tính thuế = Tổng tiền khách thanh toán qua sàn (sau khi trừ hoàn hàng, khuyến mãi, phí vận chuyển do sàn thu hộ).
• Hệ thống tự động ghi nhận theo thời điểm hoàn tất đơn hàng.

>> Tham khảo: Từ 2026, hộ kinh doanh áp dụng cách tính thuế mới theo 3 nhóm.

Bước 3: Khấu trừ thuế

• Hệ thống sàn tự động khấu trừ thuế ngay khi chuyển tiền cho người bán (thường là T+3, T+7).
• Chuyển khoản cho người bán = Doanh thu – Phí sàn – Thuế khấu trừ.

Bước 4: Kê khai và nộp thuế

• Hàng quý, nền tảng nộp tờ khai thuế khấu trừ (mẫu 06/TMĐT) và nộp tiền vào ngân sách nhà nước trước ngày 20 của tháng đầu quý sau.
• Đồng thời, gửi thông báo khấu trừ cho người bán (qua email, app) và cơ quan thuế.

>> Tham khảo: Tra cứu hóa đơn; Tra cứu hóa đơn điện tử.

Bước 5: Cấp chứng từ khấu trừ

• Nền tảng cấp chứng từ khấu trừ điện tử (PDF) cho người bán – dùng để:
  • Đối chiếu số liệu.
  • Khai bổ sung (nếu có thu nhập ngoài sàn).
  • Làm căn cứ miễn giảm thuế môn bài (nếu doanh thu < 100 triệu/năm).

Kết luận

Từ 01/7/2025, cơ chế khấu trừ và nộp thuế thay trên nền tảng TMĐT không chỉ là nghĩa vụ pháp lý mà còn là công cụ chuyển đổi số thuế hiệu quả. Người bán cần:

• Cập nhật số định danh cá nhân.
• Kiểm tra ngành nghề đăng ký trên sàn.
• Theo dõi chứng từ khấu trừ hàng quý.
• Kê khai bổ sung nếu có thu nhập ngoài sàn.

Các nền tảng cần hoàn thiện hệ thống, đào tạo người bán, và phối hợp chặt chẽ với cơ quan thuế.

Đây là bước tiến lớn để Việt Nam xây dựng hệ sinh thái TMĐT minh bạch, bền vững, nơi mọi giao dịch đều được ghi nhận, mọi nghĩa vụ thuế đều được thực thi công bằng. Dù còn những khó khăn ban đầu, cơ chế này sẽ góp phần đưa TMĐT Việt Nam lên tầm cao mới – không chỉ về quy mô, mà còn về chất lượng quản trị.

Ngoài ra, nếu quý doanh nghiệp đang tìm kiếm giải pháp phần mềm hóa đơn điện tử đáp ứng đầy đủ quy định, xin vui lòng liên hệ E-invoice để nhận được tư vấn:

CÔNG TY PHÁT TRIỂN CÔNG NGHỆ THÁI SƠN

• Địa chỉ: Số 15 Đặng Thùy Trâm – Cầu Giấy – Hà Nội
• Tổng đài HTKH: 1900 4767 – 1900 4768
• Tel : 024.37545222
• Fax: 024.37545223
• Website: https://einvoice.vn/